大多数人新买的杯子不会立即使用，因为觉得在工厂生产完成的杯子不干净，其实这个想法有失偏颇。合格的水杯的生产过程都是在无尘车间、并且严格控制气温及湿度，不会对水杯造成污染。另一方面新买的杯子在运输过程中可能经历高温、低温、潮湿、干燥等环境，TRITAN水杯虽然不会分解产生双酚A，但是包装袋可能会产生有害物质，所以新买的水杯认真清洗也很重要。
热水浸泡，可以用热水浸泡几个小时，如果有细微的颗粒会迁移到水中，可随水排出水杯，并且水是属于中性的，不会对TRITAN水杯和316不锈钢水杯产生伤害。水杯在检测时，热水常被作为检测的载体。
牛奶浸泡：牛奶具有较强的吸附性，很容易吸附外来的各种气味和物质。通过用牛奶浸泡水杯，可吸附有害物质的分子，达到清洁水杯的效果。
食盐水浸泡：食盐之所以能去油污，因为盐是一种晶体，化学名称是氯化钠。氯化钠与水溶解在一起产生化学反应具有漂白作用，能够去除污渍。并且食盐溶液能够杀菌消毒。但是316不锈钢材质的水杯不建议用盐水浸泡。
新买的杯子浸泡完成后，将所有零件拆开（注意拆开零件的数量，避免弄丢），打上中性洗涤剂，用柔软的杯刷刷洗干净，对于饮水能接触到的部件要认真清洗，如水杯内壁、硅胶塞、密封圈等。对于一些配备吸管的水杯，吸管的清洗也不容忽视，对于吸管内壁，可采用专门的吸管刷进行刷洗。清洗过程中建议用热水清洗比较好。注意不可以用硬毛刷或者钢丝球刷杯子（对于TRITAN水杯来说，容易造成划痕；对于316不锈钢水杯来说，可能会破坏杯子表面的钝化膜，使得杯子容易生锈）。最后用清水冲洗干净即可使用。
晾干：放在通风的地方晾干，避免暴晒，TRITAN材质的水杯暴晒会加速老化，暴晒对于316不锈钢杯子上的漆也有影响。
